Tous les sols ont une gamme d'organismes pathogènes permanents transmis par le sol. Mais ceux-ci sont maîtrisés dans un sol équilibré contenant de nombreux micro-organismes non pathogènes. De nombreux facteurs affectent l'équilibre du sol, notamment le drainage, la température du sol, la composition du sol, le niveau de pH, les quantités de micro-organismes qui suppriment les maladies et les environs adjacents.
25% des espèces de la Terre vivent dans le sol et sont microscopiques. Ceux-ci comprennent les bactéries, les champignons, les protozoaires et les nématodes. Ils sont tous importants dans le sol pour le cycle du carbone et des nutriments, la fertilité du sol, la filtration de l'eau et la formation d'agrégats du sol. Les micro-organismes pathogènes ne peuvent devenir dominants que si certaines conditions pédologiques et atmosphériques sont réunies.
Anaérobie vs Aérobie
Que veulent dire ces termes?
Un sol anaérobie contient peu ou pas d'oxygène. Les exemples sont les zones humides, les rizières, les vasières et les cheminées hydrothermales. Ce sont des zones riches en soufre, nitrate, sulfate et fumarate. Vous pouvez reconnaître une zone anaérobie à son odeur d'œuf pourri si le sol est riche en soufre ou à son odeur nauséabonde. Une partie de cette odeur est du méthane, un gaz à effet de serre dangereux. Votre tas de compost peut devenir anaérobie s'il n'est pas retourné. Vous saurez par son odeur. Si votre compost est devenu anaérobie (malodorant), il y aura une communauté différente de micro-organismes décomposant la matière organique que s'il reste aérobie en tournant. Un sol anaérobie conduit votre culture à se débattre.
Un sol aérobie est bien oxygéné. Il contiendra également les pores d'eau du sol. Il n'y a pas l'odeur nauséabonde associée au sol anaérobie. La communauté de micro-organismes dans un sol aérobie est assez différente de la communauté anaérobie.
Mais ce n'est pas parce qu'un sol est aérobie et contient divers micro-organismes qu'il ne contiendra pas d'agents pathogènes pouvant causer des maladies transmises par le sol chez les plantes, les humains et les animaux.
Maladies transmises par le sol et un sol équilibré
Qu'il soit anaérobie ou aérobie, le sol doit avoir un équilibre entre bactéries, champignons, nématodes, protozoaires et tous les autres macro-organismes qui composent le réseau trophique du sol. Une minorité de micro-organismes du sol sont pathogènes. Ils sont opportunistes et peuvent infecter les plantes, les personnes ou d'autres animaux de nombreuses façons. Ils peuvent également se retrouver dans un plan d'eau à cause de l'érosion hydrique. Si vous avez du bétail qui boit cette eau, ou si vous pompez cette eau à des fins agricoles, vous réinjectez des agents pathogènes dans votre sol.
On trouve plus d'organismes pathogènes dans les sols perturbés que dans les forêts. Cela signifie que les humains sont responsables d'une grande partie des agents pathogènes transmis par le sol. Par des pratiques agricoles et de jardinage, nous avons perturbé l'équilibre du sol.
Quelle partie de la communauté microbienne du sol est pathogène ?
Les micro-organismes pathogènes font partie de l'écosystème du sol. C'est seulement lorsqu'il y a un déséquilibre des types de micro-organismes que la communauté microbienne devient pathogène.
Les organismes pathogènes sont naturels dans le sol, mais lorsque les humains ajoutent de l'urine et des excréments d'animaux, ou du fumier, qui sont les principales sources d'agents pathogènes, un déséquilibre des micro-organismes du sol se produit qui peut entraîner un déséquilibre des agents pathogènes. Une fois dans le sol, ils peuvent survivre pendant de longues périodes. E. coli est un exemple d'un tel organisme transmis par le sol. De nombreuses études ont été menées et ont trouvé :
- Mauvaise hygiène . Les fermes et les installations de transformation qui n'ont pas de protocole strict concernant l'utilisation des toilettes et le lavage des mains ont connu plus d'épidémies d'E. coli que les autres fermes et installations.
- Eau d'irrigation contaminée. L'eau devenant une ressource de plus en plus précieuse, une grande partie de l'eau d'irrigation est recyclée. Des tests d'eau réguliers vous feront économiser de l'argent et votre réputation.
Bien que le sol contienne des agents pathogènes, gardez à l'esprit que la grande majorité des micro-organismes du sol font partie d'un écosystème qui offre de nombreux avantages essentiels aux plantes, aux personnes et aux animaux. Comprendre les conditions de l'écosystème et les pratiques agricoles qui favorisent la maladie. Surveillez régulièrement vos cultures pour détecter tout problème avant qu'il ne devienne majeur et vous éviterez les problèmes phytopathogènes sur votre ferme.
Quel est l'impact de la santé du sol sur la santé humaine ?
Les maladies transmises par le sol peuvent devenir un problème de santé pour plusieurs raisons. Si vous marchez sur un morceau de métal rouillé, vous devez vous faire vacciner contre le tétanos (sauf si vous en avez reçu un récemment). La bactérie Clostridium tetani (qui cause le tétanos) peut se trouver sur le métal rouillé, mais elle vit en fait dans le sol, la poussière et le fumier. Le fait qu'il soit encore vivant sur le métal atteste de sa capacité à survivre.
Les bactéries sont le micro-organisme le plus abondant dans le sol. Salmonella, E. coli et Campylobacter sont des bactéries courantes présentes presque dans le monde entier que nous considérons généralement comme pathogènes. Mais chacune de ces bactéries a des familles diverses, certains membres peuvent être pathogènes, alors que la plupart ne le sont pas. E. coli a une souche porteuse d'une maladie transmise par le sol, mais la plupart des E. coli sont inoffensifs et font même partie d'un tractus intestinal humain sain.
Les maladies transmises par le sol affectent le plus les personnes immunodéprimées. Mais même les personnes dont le système immunitaire est sain peuvent tomber malades. La majorité des maladies transmises par le sol sont causées par des micro-organismes opportunistes. Ils infectent les plantes, les personnes ou d'autres animaux en ingérant l'agent pathogène, en l'inhalant ou à travers une plaie ouverte. Au fur et à mesure que la plaie guérit, notre corps crée un environnement parfait pour la croissance du micro-organisme. Un système immunitaire sain prendra soin de ce micro-organisme étranger.
Les pratiques agricoles ont également un impact sur la santé humaine. Lorsque vous disquez votre champ et que vous créez de la poussière, vous mettez dans l'air des agents pathogènes qui se trouvaient dans votre sol. Si c'est une journée venteuse, ces agents pathogènes du sol peuvent se retrouver chez vos voisins. Respirer cette poussière, c'est aussi respirer des agents pathogènes transmis par le sol.
Comment réduire les maladies transmises par le sol
Il existe plusieurs pratiques de bon sens que nous pouvons tous appliquer pour réduire le risque de tomber malade à cause d'un agent pathogène du sol. Il y a aussi certaines pratiques que nous devons considérer.
- Portez des gants lorsque vous jardinez ou cultivez. Cela semble enlever une partie de la joie de "jouer dans le sol", mais si vous savez que votre sol n'a pas de fumier brut, vous pouvez les enlever.
- Lavez-vous les mains après avoir touché de la terre, des animaux ou des matériaux susceptibles de contenir du fumier. Le fumier est la première source d'agents pathogènes. Lorsque vous avez fini de ramasser les œufs, de parcourir vos champs pour la surveillance ou la récolte, lavez-vous les mains.
- Reconsidérez le discage de vos champs . Pensez aux cultures de couverture. Les agents pathogènes aéroportés sont tout aussi dangereux que ceux transmis par le sol et peuvent être évités par des pratiques agricoles qui utilisent le semis direct ou le travail minimum du sol.
Un sol sain est un sol en équilibre. Il y a des bactéries, des champignons, des nématodes, des protozoaires et d'autres organismes dans votre sol qui agissent comme proies et prédateurs. Lorsque nous perturbons cet équilibre, nous créons des opportunités pour que les agents pathogènes des maladies transmises par le sol dominent le réseau trophique du sol. Lorsque nous essayons de résoudre le déséquilibre avec les pesticides et les herbicides, nous créons un problème plus important.
Travailler avec la nature plutôt que contre elle corrigera le déséquilibre. Les agents pathogènes du sol n'auront aucune chance face à une armée de micro-organismes bénéfiques. La santé des sols est importante pour la santé humaine. Les agents pathogènes qui créent des maladies transmises par le sol qui affectent la santé humaine deviennent moins virulents avec un sol équilibré et lorsque nous comprenons les impacts que nous, en tant qu'êtres humains, avons sur notre propre santé.
